為了解決這種動態條件下污染物外泄的問題，緩沖間的設置就必不可少了。緩沖間的兩側門不能同步開啟，起到了氣閘的作用。內側門開啟時，少量的污染物泄露到緩沖間內部，此時關閉內部門，開啟外部門，因為空氣的擴散速度有限，再通過緩沖間內擴散到外部的污染物就非常少。許鐘麟等人的計算得出，兩個房間間設置緩沖間的情況較兩個房間間直接開門的情況，對污染物的控制能力相差40多倍，體現出了緩沖間的重要性。
在極端條件下，即使病房的負壓系統停止運作，只要有緩沖間的存在，還是能一定程度上保障房間的安全性。而反之，負壓病房不設緩沖間，則毫無意義。因此可以說，負壓隔離病房的“隔離”比“負壓”重要。
隔離病房內部的氣流組織
隔離病房內部進行合理的氣流組織可以加快污染物的排出，避免氣流形成死角造成污染物的長期積聚，一般應通過送排風口位置的布置，使室內形成定向氣流
根據北京市地方標準《負壓隔離病房建設配置基本要求》建議，是將主次送風風口設置在病床的床側和床尾上方，這是考慮到進行床旁處置時醫務人員的站位，而排風風口設置在送風口的對側床頭下方，使主要產生于患者口鼻處的氣溶膠可直接外排而減少對室內其他區域的影響。這是單人間病房的情況。
針對雙人間病房，目前也有設計單位通過計算機進行風場模擬，認為將送排風口分別設置于同側上下兩端，對污染物的控制效果。
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